畢業論文

打賞
當前位置: 畢業論文 > 生物論文 >

芽孢桿菌D1菌株的基因組測序和突變株基因文庫構建

時間:2019-06-01 09:24來源:畢業論文
芽孢桿菌D1菌株是從堆肥中分離出來的一種以香草酸為唯一碳源和氮源生長的嗜熱芽孢桿菌。它的生長的溫度范圍在50?70 oC,最適生長溫度為55oC。D1菌株是一個優秀的環境污染物降解菌

摘要:芽孢桿菌D1菌株是從堆肥中分離出來的一種以香草酸為唯一碳源和氮源生長的嗜熱芽孢桿菌。它的生長的溫度范圍在50−70 ºC,最適生長溫度為55ºC。D1菌株是一個優秀的環境污染物降解菌株。D1菌株利用一個叫做NIH shift的反應降解對羥基苯甲酸,該反應機制尚不明了。本論文為了闡明NIH shift的全貌,首先對D1菌株的基因組進行測序,探索NIH shift相關基因。為了從基因水平,代謝水平上闡明降解機理,摸索了利用紫外線照射法構建突變株基因文庫的方法。通過控制UV照射時間,使存活率控制在20%~30%之間最終成功得到了D1菌株的突變株基因文庫,并進行冷藏保存。35827
畢業論文關鍵詞:芽孢桿菌,基因文庫,紫外照射,突變株
Bacillus strains D1 genome sequencing and mutant gene library building
Abstract: Bacillus strains isolated from compost D1 a vanillic acid as sole carbon source and nitrogen source of thermophilic bacillus. The growth of its temperature ranges from 50-70 DHS C, the optimum growth temperature is 55 DHS C .D1 strains is an excellent environmental pollutants degradation strains.D1 strains using a process called NIH shift the reaction of the degradation of p-hydroxy benzoic acid, the reaction mechanism is still unknown.This paper in order to clarify the outline of the NIH shift, the genome sequencing of D1 strains, explore the NIH shift related genes.For from the level of genes, metabolism to clarify the degradation mechanism, grope for the use of ultraviolet radiation method build mutant gene library method. By controlling the UV irradiation time, makes the control of survival rate between 20% ~ 30% final success in getting D1 strain of the mutant gene library, and cold storage.
Key words:Bacillus,Gene library,Ultraviolet irradiation,Mutant strains
目錄
引言    1 源¥自%六^^維*論-文+網=www.aftnzs.live
1 材料與方法    2
1.1菌株材料    2
1.2主要試劑    2
1.2.1生化試劑與分子生物學試劑    2
1.3 方法    2
1.3.1 DNA提取    2
1.3.2   PCR擴增16S rDNA    4
1.3.3提取質粒    5
1.3.4 16s RNA測序    5
1.3.5 全基因組測序、合同簽訂    5
1.3.6最適照射時間    5
2   結果與分析    6
2.1   總DNA提取    6
2.2   PCR擴增16S rDNA    6
2.3   PCR反應產物檢測及純化    7
2.4   驗證D1菌株中有無質粒    8
2.5   16S rDNA測序    9
2.6 檢索并繪制系統發育樹    10
2.7 全基因組測序    10
2.8 最適照射時間    12
3   討論    14
致謝    14
參考文獻    14
引言
芽孢桿菌D1菌株是從堆肥中分離出來的一種以香草酸為唯一碳源和氮源的嗜熱芽孢桿菌。它的生長的溫度范圍在50−70 ºC,最適生長溫度為55ºC。D1菌株是一個優秀的環境污染物降解菌株。D1菌株利用一個叫做NIH shift的反應降解對羥基苯甲酸,該反應機制尚不明了。關于對羥基苯甲酸(4 - hydroxy benzoic acid,4HBA)的微生物降解研究從上世紀五十年代開始到現在已經開展了許多研究工作。在一部分好氧微生物中,4HBA的降解首先由單加氧酶(monooxygenase)或水解酶(hydroxylase)把4HBA轉化成原兒茶酸(protocatechuic acid, PCA)[7][15]。原兒茶酸是一個可以被雙加氧酶開環的化合物。最終代謝產物進入三羧酸循環。 源¥自%六^^維*論-文+網=www.aftnzs.live
有些菌株對4HBA的降解是通過鄰苯二酚(catechol)開環途徑。這個途徑的關鍵酶是4-羥基苯甲酸脫碳酸酶(4-hydroxybenzaote decarboxylase),催化4HBA的脫碳酸反應生成苯酚[13][15]。而后在單加氧酶的催化下轉化成鄰苯二酚,然后雙加氧酶在1,2位或2,3位間將其開環,進入三羧酸循環[1]。 芽孢桿菌D1菌株的基因組測序和突變株基因文庫構建:http://www.aftnzs.live/shengwu/20190601/33963.html
------分隔線----------------------------
推薦內容
双色球走势图带连线