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油菜A20/AN1鋅指蛋白挖掘與鑒定

時間:2019-05-27 13:15來源:畢業論文
利用生物信息學方法和技術,對油菜A20/AN1鋅指蛋白進行分析,以了解其相關結構和功能信息。生物信息學分析顯示該蛋白位于細胞質中,具有磷酸化位點,參與細胞轉錄調控

摘 要:A20/AN1鋅指蛋白普遍存在于真核生物中,是一類龐大的轉錄調控因子家族,通過與核酸或蛋白質結合行使植物功能,參與多個生理過程。近年來研究發現,植物A20/AN1鋅指蛋白在脅迫回應引起的信號傳導過程中發揮著重要作用。本文利用生物信息學方法和技術,對油菜A20/AN1鋅指蛋白進行分析,以了解其相關結構和功能信息。生物信息學分析顯示該蛋白位于細胞質中,具有磷酸化位點,參與細胞轉錄調控。油菜A20/AN1鋅指蛋白被分為3類,三類A20/AN1鋅指蛋白氨基酸長度、等電點差異不大,且序列中20種常見氨基酸含量接近;三種蛋白的二級結構均以無規則卷曲為主,其次是α螺旋,延伸鏈和β-轉角比例較少。本文主要通過對油菜A20/AN1鋅指蛋白進行挖掘與鑒定,以獲得有功能的相關蛋白基因,對作物耐逆性進行遺傳改良,提高作物的耐逆能力。35775
畢業論文關鍵字:油菜;A20/AN1鋅指蛋白;序列分析;生物資訊學
Mining and Identification of A20/AN1 Zinc Finger Protein in Brassica napus L
Abstract: A20/AN1 zinc finger protein generally existing in eukaryotic, is a kind of large family of transcription regulatory factors, through combination with nucleic acid or protein, they conduct exact function , involving in multiple physiological processesin plant. The study in recent years found that, the A20/AN1 zinc finger protein plays an important role in the process of signal transduction in the stress response. Using bioinformatics methods and techniques, we analyzed the A20 / AN1 zinc finger protein from rapeseed, to understand its structure and function of the relevant information. The results showed that the protein is located in the cytoplasm, with different phosphorylation site, they participate in cell transcriptional regulation. Results also showed that the A20 / AN1 zinc finger proteins are pided into three categories, they have small difference in acids length, isoelectric point, with 20 common amino acids composition; The secondary structure OF three kinds of protein mainly include random coil, then alpha helix, extending chain and beta-turns. In this article, we mainly mined and identified the A20/AN1 zinc finger protein of Brassica napus L, for obtaining their function information, improving and increasing crop resistance to stresss. 源¥自%六^^維*論-文+網=www.aftnzs.live
Key words: Rapeseed; A20/AN1 zinc finger protein; Sequence analysis; Bioinformatics
目    錄
摘  要    1
引  言    2
1材料和方法    2
1.1材料來源    3
1.2 A20/AN1鋅指蛋白的生物信息學分析    3
2結果和分析    3
2.1 油菜A20/AN1鋅指蛋白序列獲取與分析    3
2.2 A20/AN1鋅指蛋白的亞細胞定位結果    4
2.3 蛋白氨基酸序列同源比對和進化分析    5
2.3.1蛋白氨基酸序列同源比對    5
2.3.2 蛋白氨基酸序列構建進化分析    6
2.4 蛋白質跨膜區、磷酸化分析    7
2.5 蛋白的二級結構及保守域分析    8
2.6 蛋白紊亂區、球蛋白區預測    9
3結論與討論    9
參考文獻    11
致  謝    13
油菜A20/AN1鋅指蛋白挖掘與鑒定 引言:油菜(Brassica napus L.)屬于十字花科,是世界四大主要油料作物之一,我國油菜產量居世界油料作物產量的第三位。我國大多數地區均可以種植油菜,但低溫寒害、干旱、風和病害等逆境脅迫嚴重影響了油菜生產產量。擬南芥隸屬于十字花科,廣泛用于植物遺傳學、發育生物學和分子生物學的研究,而且對它的研究比較透徹,全部基因組測序已經完成。油菜的大部分基因與擬南芥的基因存在這很高的同源性,所以可以利用擬南芥的相關蛋白序列來分析油菜同源序列。 油菜A20/AN1鋅指蛋白挖掘與鑒定:http://www.aftnzs.live/shengwu/20190527/33882.html
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