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激酶藥物設計任務書

時間:2019-04-20 14:33來源:畢業論文
題目:苯并噻唑類似物抑制T3151野生和突變的Bcr-Abl激酶的計算機輔助藥物設計研究 專業:應用化學 任務起至日期: 一、課題的任務內容: 本論文將采用3D-QSAR法,在SYBYL-X 2.0的水平下,

題目:苯并噻唑類似物抑制T3151野生和突變的Bcr-Abl激酶的計算機輔助藥物設計研究
專業:應用化學
任務起至日期:
一、課題的任務內容:
本論文將采用3D-QSAR法,在SYBYL-X 2.0的水平下,以部分分子結構和生物活性(pIC50值)已知的苯并噻唑類似物分子為訓練集, 選用此系列分子的各種分子力場(立體場、靜電場、疏水場、氫鍵供體場、氫鍵受體場等) 用三維定量構效關系(3D-QSAR) 方法建立反映分子結構與生物活性之間的定量構效關系模型。并基于此模型來設計新的苯并噻唑類似物分子和進行結構修飾。
二、原始條件及數據:34710
 
原始資料來自于文獻和指導教師提供的資料
三、設計的技術要求(論文的研究要求):
 
建立具有顯著統計學意義,預測能力良好的3D-QSAR模型
四、畢業設計(論文網)應完成的具體工作:
 
1.分子結構的搭建;
2.分子結構的優化;
3.分子的疊合;
4.3D-QSAR模型的建立;
5.模型的有效性檢驗、新型活性分子設計及結構修飾。 

軟硬件名稱、內容及主要的技術指標(可按以下類型選擇):
計算機軟件   
SYBYL-X 2.0 
結 構 模 型     √
  源¥自%六:維;論-文'網=www.aftnzs.live
五、查閱文獻要求及主要的參考文獻
          
 要求:查閱中文文獻13篇,外文文獻13篇以上

主要參考文獻:
1. Discovery of new benzothiazole-based inhibitors of breakpoint cluster region- ablelson kinase including the t315i mutant
 Seunghee Hong,Jinhee kim, Sun-Mi Yun,Hyunseung Lee, Yoonsu Park, Soon-Sun Hong and Sungwoo Hong
2. Disovery of Picomolar ABL Kinase Inhibitors Equipotent For Wild type and T135I mutant via structure-based de Novo Design
 Hwangseo Park ,Seunghee Hong, Jinhee Kim and Sungwoo Hong
 
六、進度安排:(設計或論文各階段的要求,時間安排):
求計算機應用能力和英語閱讀能力較強 工作計劃:要求完成下列內容: 1.分子結構的搭建; 2.分子結構的優化; 3.分子的疊合;4.3D-QSAR模型的建立;5.模型的有效性檢驗、新型活性分子設計及結構修飾。 工作計劃: 第1周 — 第3周 查閱文獻和收集資料。 第4周 — 第13周 分子結構的搭建、優化、模型的建立與驗證 第14周 — 第15周 新型活性分子設計及結構修飾 第16周 — 第18周 撰寫論文,準備答辯。 激酶藥物設計任務書:http://www.aftnzs.live/renwushu/20190420/32313.html
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