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HMGR為靶標的生態友好殺蟲劑的設計

時間:2019-05-16 12:51來源:畢業論文
運用同源建模,分子對接,分子動力學模擬和3D-QSAR等模擬方法對煙草天蛾的HMGR結構和課題組合成并測試抑制昆蟲JH體內合成的偕二氟他汀類類似物進行初步研究

摘要:本文運用同源建模,分子對接,分子動力學模擬和3D-QSAR等模擬方法對煙草天蛾的HMGR結構和課題組合成并測試抑制昆蟲JH體內合成的偕二氟他汀類類似物進行初步研究,結果顯示:可以通過人的HMGR晶體結構模建昆蟲的HMGR三維結構,分子對接分析結果表明他汀類分子與昆蟲HMGR的結合方式與人的HMGR結合方式不同,對比抑制HMGR的IC50值表示,初步說明HMGR可以作為農藥新靶點的猜想是成立的,再通過分子動力學模擬結果中△Gbinding自由能大小進一步驗證了這個猜想。所得的結論不僅對設計出高的酶活性,選擇性和安全性statin藥物提供指導,而且可以為開發一種新的綠色農藥給予一定的理論指導。35405
畢業論文關鍵詞:殺蟲劑;三維定量構效關系;HMGR抑制劑;保幼激素
Abstract: The 3D-QSAR methods (CoMFA and CoMSIA) were used to study the relationship between the structures of gem-difluoro fluorine statin analogs which were synthesized by our group and their inhibition of insect JH biosynthesis in vitro. The manduca sexta HMGR structure and docking of their inhibitors were also studied with homology modeling, molecular docking and molecular dynamics simulations in this paper. Our results show: the human HMGR crystal structure modeling insect HMGR three-dimensional structure, molecular docking analysis showed different statin molecules and insect HMGR the binding mode and human HMGR binding mode, compared to inhibition with IC50 values HMGR said preliminary Description HMGR as a new target for pesticide guess is established through molecular dynamics simulations of the free energy △Gbinding size further validate this conjecture. The conclusion is not only to provide guidance on the design of a high activity, selectivity and safety of statins, but also for the development of a new green pesticide give particular theoretical guidance. 源¥自%六:維;論-文'網=www.aftnzs.live
Keywords:  Insecticide, 3D-QSAR, HMGR inhibitor, Juvenile Hormone
目錄
1 緒論    1
1.1 研究背景和意義    1
1.1.1  綠色農藥研發的必要性    1
1.1.2  靶標藥物的簡介    2
1.1.3  新型殺蟲劑的簡介    2 
1.1.4  新型殺蟲劑的作用方式    3
1.2 HMGR的簡介    4
1.2.1 HMGR定義    4
1.2.1 以羥甲戊二酰輔酶A還原酶為靶標開展害蟲防治的嘗試    4
1.2.2 羥甲戊二酰輔酶A還原酶研究進展    6
1.3 計算機輔助藥物設計的簡介    7
1.3.1  CADD的定義    7
1.3.2  Sybyl軟件的簡介    7
1.3.3  定量構效關系    8
1.3.3.1  QSAR的發展    8
1.3.3.2  QSAQ中的結構參數     10
1.3.4  分子對接    11
1.4  研究內容    13
2 實驗步驟    13
2.1 QSAR研究    13
2.1.1 分子構建和分子表單創建    13
  2.1.2 分子疊合    17
2.1.3 CoMFA計算    17
2.1.4 PLS分析    17
2.1.5 模型活性預測    17
2.1.6 模型的等質圖    17
2.2 分子對接    18
2.3 分子動力學模擬    18
3實驗模型結果的分析與檢驗    19
3.1 3D-QSAR模型結果和分析    19
3.2 煙草天蛾和意峰的HMGR的同源建模結果分析    25 源¥自%六:維;論-文'網=www.aftnzs.live
3.3 分子對接分析結果分析    28
3.4 分子動力學模擬結果分析    29
4 總結    31
5 致謝    32 HMGR為靶標的生態友好殺蟲劑的設計:http://www.aftnzs.live/huaxue/20190516/33328.html
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